没参加高考怎么了我保送的第682章 惊人的共识
京都的夜晚山中教授在阅读论文时眼中则闪烁着不同的光芒。
他更关注这项发现对“理解并编程细胞”这一终极目标的启示。
他对SFR-1作为分子决策器的“双面人格”机制赞叹不已。
“这简直是大自然设计的天然逻辑门！”他在审稿意见中写道：“这项工作为合成生物学提供了全新的、源自生命内在智慧的‘元件库’。
” 但他也提出：“作者是否考虑过这种变构调控是否具有可设计性？例如能否通过蛋白质工程改造SFR-1的变构界面使其响应人工设计的小分子或光信号从而实现对细胞内运输的人为精确操控？” 他将审稿提升到了“应用与设计”的更高维度。
作为iPS领域的先驱他敏锐地联想到细胞重编程过程中的信号整合与命运决定。
“在细胞命运转变（如体细胞重编程）过程中这个‘调度网络’的动态是否发生了重塑？其状态的改变是否是决定重编程效率的关键之一？” 他建议作者可以在讨论部分就该项发现与细胞身份调控的潜在联系进行更深入的展望这将极大拓宽论文的学术影响力。
山中的审稿意见充满了建设性他不仅仅只是评审者同时也像是一位思想上的共鸣者与引路人指引着这项基础发现走向更广阔的应用天地。
...... 而在斯坦福大学法森特博士的审阅则完全沉浸在数据和代码的海洋里。
他要求《细胞》编辑部提供了论文中所有关键计算的补充方法细节、部分代表性模拟的输入参数文件、甚至部分自定义分析脚本的代码。
他仔细检查了模拟体系的构建是否合理类如力场选择、水模型、离子浓度、膜脂组成等等。
模拟时间是否足以达到平衡并采集到统计显着的数据。
“微秒级模拟对于捕获这种构象变化是挑战性的。
”他如是评价道：“作者需要提供更充分的收敛性分析数据如RMSD随时间变化、关键相互作用距离的分布等以证明所观察到的构象变化是体系固有的性质而非采样不足导致的假象。
” 对于预测“影子网络”的数据模型他提出了最尖锐的问题：“模型的训练数据集是什么？其架构和超参数选择依据为何？如何避免过拟合？更重要的是模型做出的预测哪些是基于数据中真实存在的模式哪些可能是模型自身偏差产生的？” 他要求作者提供模型的可解释性分析例如通过扰动输入数据观察哪些特征对预测“影子网络”成员最关键从而为这个发现的“网络”提供生物学上的合理性支撑。
法森特的审稿意见极其技术化充满了公式和术语。
他的认可是这篇论文计算部分可信度的“通行证”。
他的质疑也同样直指交叉学科研究中最容易被传统生物学家诟病的软肋。
...... 米国加州。
布莱克本教授正待在家里打开了书房里的台灯。
她不习惯在电脑上审稿而是喜欢戴着眼镜将论文全文打印下来一个字一个字细细审阅。
她快速把握了论文的核心脉络并将其置于整个生物学研究的大图景中进行考量展现出一种纵观全局的智慧。
她敏锐地注意到论文提出的“变构开关”、“精准识别”与“分布式冗余”三大机制共同构筑了一个逻辑严密、且符合进化论思想的“智能”系统。
“这项工作不仅提供了新的部件更描绘了一幅关于细胞内部组织协调性的、更具整体性的新图景这在当今碎片化的研究中尤为珍贵。
”她在笔记中写道。
她认同拉斐尔斯关于补充生化实验的重要性但也指出在如此一篇开创性的论文中要求每一个计算预测都立刻有完美的实验验证是不现实的这会极大地延缓重大发现的传播。
她更倾向于建议作者在表述上更加精准明确区分哪些是已有强证据支持的结论哪些是基于强大计算证据的、有待进一步验证的极有可能的假设。
她认为论文的价值在于其开创的新范式而非每一个细节的完美无缺。
与其他人不同的是她特别关注这项研究对疾病理解的潜在影响。
“作者在讨论中提到了癌症和神经退行性疾病这是一个很好的方向。
如果能初步展示在某种疾病模型如特定癌细胞系中这个‘调度网络’的关键节点确实发生了改变或失调将极大地增强论文的广泛吸引力和临床相关性。
” 她建议补充一些探索性的数据哪怕只是初步的也能为后续研究指明方向。
布莱克本教授的审稿意见更像是一份高水平的战略指导。
她权衡了创新性与严谨性之间的平衡指出了提升论文影响力的关键点并以其崇高的威望为这篇可能引发争议的论文提供了一份至关重要的“背书”。
尽管视角各异但四位审稿人达成了一个惊人的共识。
这项工作是卓越的、开创性的具有颠覆现有细胞生物学教科书的潜力。
他们都明确建议《细胞》接受发表。
然而他们也提出了不容回避的、极其细致的修改意见。
主要集中在需要补充更直接的生化实验验证、提供更详尽的计算模型可靠性分析、以及在表述上更清晰地界定结论与假说。
当这四份分别来自慕尼黑、京都、斯坦福和旧金山的、凝聚了当今世界顶尖智慧的审稿报告几乎同时在72小时期限截止前返回《细胞》编辑部时主编玛格丽特·塞缪尔森深吸了一口气。
因为她知道最艰难的部分过去了稿件得到了最高权威们的原则性认可。
接下来将是编辑部与陆时羡团队紧密合作根据这些极其专业和苛刻的意见对这篇注定要震撼学界的论文进行最后打磨的时刻。
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